List Variants (Markers/SNPs)
Arguments
- con
A
brapi_connection()object.- variantSetDbId
Character or NULL. Filter by variant set.
- ...
Additional query parameters.
Examples
# \donttest{
con <- brapi_connection("https://test-server.brapi.org")
brapi_variants(con, variantSetDbId = "variantset1")
#> # A tibble: 20 × 23
#> additionalInfo externalReferences alternate_bases alternateBases ciend cipos
#> <lgl> <lgl> <lgl> <lgl> <lgl> <lgl>
#> 1 NA NA NA NA NA NA
#> 2 NA NA NA NA NA NA
#> 3 NA NA NA NA NA NA
#> 4 NA NA NA NA NA NA
#> 5 NA NA NA NA NA NA
#> 6 NA NA NA NA NA NA
#> 7 NA NA NA NA NA NA
#> 8 NA NA NA NA NA NA
#> 9 NA NA NA NA NA NA
#> 10 NA NA NA NA NA NA
#> 11 NA NA NA NA NA NA
#> 12 NA NA NA NA NA NA
#> 13 NA NA NA NA NA NA
#> 14 NA NA NA NA NA NA
#> 15 NA NA NA NA NA NA
#> 16 NA NA NA NA NA NA
#> 17 NA NA NA NA NA NA
#> 18 NA NA NA NA NA NA
#> 19 NA NA NA NA NA NA
#> 20 NA NA NA NA NA NA
#> # ℹ 17 more variables: created <lgl>, end <lgl>, filtersApplied <lgl>,
#> # filtersFailed <lgl>, filtersPassed <lgl>, referenceBases <lgl>,
#> # referenceName <lgl>, referenceDbId <lgl>, referenceSetName <lgl>,
#> # referenceSetDbId <lgl>, start <lgl>, svlen <lgl>, updated <lgl>,
#> # variantDbId <chr>, variantNames <list>, variantSetDbId <list>,
#> # variantType <lgl>
# }